Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Poodle

Updated Dec 22, 2024

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA1 #	STR types	Poodle (n=5622)
1001	380 373 281 182	0.26601
1002	380 365 281 181	0.16044
1003	387 375 277 186	0.17432
1004	393 379 277 183	0.08378
1005	389 371 277 181	0.06937
1006	387 375 293 180	0.04945
1007	380 372 281 182	0.03335
1008	386 373 289 182	0.01236
1009	382 377 277 184	0.01494
1010	384 371 277 186	0.01129
1011	376 365 281 180	0.01930
1012	388 369 289 188	0.01459
1013	392 373 289 186	0.00854
1014	375 373 287 178	0.01085
1015	380 373 291 186	0.00125
1016	382 371 277 178	0.02134
1017	386 373 289 178	0.00240
1018	375 373 287 186	0.00987
1019	380 373 287 185	0.00293
1020	388 369 289 184	0.00285
1021	380 373 289 186	0.00178
1022	380 375 281 181	0.00009
1023	380 379 281 181	0.00009
1024	387 373 281 182	0.00009
1025	380 365 281 186	0.00018
1026	390 369 289 186	0.00329
1027	391 371 277 181	0.00044
1028	376 369 291 186	0.00107
1029	380 365 281 182	0.00160
1030	380 373 293 178	0.00213
1031	382 371 277 186	0.00125
1032	382 377 277 178	0.00009
1033	382 379 277 181	0.00338
1034	382 379 277 182	0.00053
1035	386 373 277 184	0.00009
1036	389 365 289 180	0.00160
1040	380 371 277 186	0.00053
1043	393 381 277 183	0.00142
1045	376 371 277 186	0.00062
1046	376 379 291 180	0.00036
1052	380 372 289 184	0.00036
1053	382 377 277 186	0.00018
1054	382 379 277 184	0.00018
1065	380 371 277 181	0.00018
1069	380 365 281 184	0.00009
1084	376 373 277 184	0.00027
1092	376 379 277 181	0.00018
1093	386 379 277 180	0.00044
1102	389 375 293 180	0.00009
1103	389 375 293 181	0.00018
1105	382 379 277 178	0.00374
1106	395 379 277 178	0.00009
1107	376 375 293 183	0.00018
1109	381 379 291 186	0.00151
1111	387 378 287 182	0.00009
1130	380 373 287 178	0.00009
1134	384 365 291 178	0.00018
1141	380 365 281 180	0.00018
1168	382 379 289 186	0.00018
1169	380 365 277 180	0.00098
1225	387 374 287 186	0.00009
1234	380 371 281 181	0.00018
1265	387 375 277 184	0.00009
1270	376 365 281 181	0.00009
1271	387 375 277 181	0.00018
1279	393 379 277 186	0.00009
null		0.00009

DLA Class II Haplotype Frequencies

DLA2 #	STR types	Poodle (n=5622)
2001	343 324 284	0.60005
2002	343 327 280	0.08511
2003	343 324 282	0.10610
2004	351 327 268	0.03059
2005	339 322 280	0.01503
2006	339 325 280	0.03335
2007	351 327 280	0.01716
2008	339 327 276	0.01503
2009	351 324 280	0.00703
2010	345 329 280	0.01129
2011	345 322 284	0.01939
2012	345 322 280	0.00729
2013	345 327 284	0.01032
2014	339 322 284	0.01930
2015	339 327 280	0.00400
2016	339 323 284	0.00311
2017	343 322 280	0.00213
2019	345 324 284	0.00009
2020	349 324 284	0.00018
2021	339 324 268	0.00382
2022	339 327 282	0.00044
2023	341 323 282	0.00213
2024	343 323 280	0.00062
2025	351 321 280	0.00160
2026	351 324 284	0.00098
2028	345 327 288	0.00053
2032	339 323 280	0.00044
2035	341 323 280	0.00009
2037	341 327 280	0.00044
2039	345 327 276	0.00053
2040	345 327 280	0.00009
2048	339 331 282	0.00018
2050	341 327 284	0.00018
2053	343 324 280	0.00009
2064	351 327 284	0.00089
2066	339 324 280	0.00009
2101	341 324 280	0.00018
2115	343 327 284	0.00009

Allele Frequencies

#	Locus Name	Allele	Poodle (n=5627)
1	AHT121	92	0.01262
		94	0.02249
		96	0.01236
		98	0.31627
		100	0.08533
		102	0.00640
		104	0.19796
		106	0.08338
		108	0.17227
		110	0.06693
		112	0.02311
		114	0.00080
		116	0.00009
2	AHT137	131	0.23214
		133	0.01040
		135	0.00044
		137	0.17552
		139	0.00044
		141	0.36580
		143	0.01315
		145	0.04630
		147	0.05839
		149	0.00258
		151	0.09456
		153	0.00027
3	AHTH130	111	0.01692
		117	0.00234
		119	0.38000
		121	0.14161
		123	0.07823
		125	0.00117
		127	0.13333
		129	0.21651
		131	0.01521
		133	0.01260
		135	0.00207
4	AHTh171-A	217	0.00604
		219	0.37022
		221	0.23084
		223	0.00622
		225	0.14151
		227	0.00898
		229	0.04942
		231	0.02187
		233	0.00151
		235	0.14391
		237	0.01947
5	AHTh260	238	0.57335
		240	0.03121
		242	0.00027
		244	0.05885
		246	0.18732
		248	0.06437
		250	0.03387
		252	0.03672
		254	0.00613
		256	0.00791
6	AHTk211	87	0.18308
		89	0.03937
		91	0.67419
		93	0.00409
		95	0.09909
		97	0.00018
7	AHTk253	280	0.00889
		284	0.12791
		286	0.11360
		288	0.40444
		290	0.21449
		292	0.12996
		296	0.00071
8	C22.279	116	0.08027
		118	0.40053
		120	0.00471
		124	0.35600
		126	0.06844
		128	0.02160
		130	0.06836
		134	0.00009
9	FH2001	124	0.01983
		132	0.42842
		136	0.07078
		140	0.01814
		144	0.24009
		148	0.20914
		152	0.01245
		158	0.00116
10	FH2054	148	0.01058
		152	0.03147
		156	0.55139
		160	0.01751
		164	0.00347
		168	0.29641
		172	0.07744
		176	0.01076
		180	0.00098
11	FH2848	230	0.01521
		232	0.01583
		234	0.01263
		236	0.05326
		238	0.13712
		240	0.68878
		242	0.07665
		244	0.00018
		246	0.00036
12	INRA21	91	0.35467
		93	0.00009
		95	0.40364
		97	0.04773
		99	0.05529
		101	0.11431
		103	0.00747
		105	0.01387
		109	0.00293
13	INU005	110	0.01982
		120	0.00009
		122	0.00053
		124	0.51396
		126	0.44853
		128	0.00187
		130	0.01173
		132	0.00116
		138	0.00231
14	INU030	144	0.32329
		146	0.14933
		148	0.06524
		150	0.08702
		152	0.37396
		154	0.00080
		156	0.00027
		158	0.00009
15	INU055	208	0.00160
		210	0.21867
		212	0.05929
		214	0.29431
		216	0.37004
		218	0.03947
		220	0.01538
		222	0.00124
16	LEI004	85	0.65369
		95	0.10124
		97	0.00489
		105	0.00071
		107	0.20693
		109	0.03253
17	REN105L03	227	0.01022
		231	0.27951
		233	0.19677
		235	0.00747
		237	0.01511
		239	0.01173
		241	0.47894
		243	0.00027
18	REN162C04	200	0.02054
		202	0.17079
		204	0.06846
		206	0.54410
		208	0.08935
		210	0.06392
		212	0.04276
		214	0.00009
19	REN169D01	202	0.00980
		210	0.00134
		212	0.07053
		214	0.00089
		216	0.41086
		218	0.25752
		220	0.00196
		222	0.05067
		224	0.17453
		226	0.02191
20	REN169O18	156	0.00124
		160	0.03413
		162	0.56533
		164	0.31538
		166	0.01751
		168	0.02418
		170	0.03289
		172	0.00933
21	REN247M23	266	0.03395
		268	0.52808
		270	0.23240
		272	0.19845
		274	0.00249
		278	0.00462
22	REN54P11	222	0.00320
		226	0.26693
		228	0.16676
		230	0.00400
		232	0.33493
		234	0.20924
		236	0.00409
		238	0.01004
		242	0.00080
23	REN64E19	139	0.00240
		143	0.00507
		145	0.42720
		147	0.24702
		149	0.03529
		153	0.25680
		155	0.02622
24	VGL0760	12	0.29676
		13	0.00124
		14	0.01387
		15	0.00845
		18	0.00151
		19	0.08508
		19.2	0.14056
		20	0.03645
		20.2	0.16092
		21	0.00133
		21.2	0.05379
		22.2	0.01698
		23.2	0.10873
		24.2	0.05974
		25.2	0.01414
		26.2	0.00044
25	VGL0910	12	0.00044
		13	0.04871
		14	0.01724
		15	0.01893
		15.1	0.01591
		16	0.00027
		16.1	0.00480
		17.1	0.10738
		18.1	0.27200
		19	0.00009
		19.1	0.12996
		20.1	0.04213
		21.1	0.27618
		22	0.00729
		22.1	0.02320
		23	0.03049
		23.1	0.00373
		24	0.00124
26	VGL1063	8	0.02818
		9	0.00222
		10	0.00009
		11	0.00160
		12	0.03449
		13	0.16284
		14	0.13840
		15	0.08720
		16	0.09796
		17	0.03236
		18	0.04382
		19	0.29707
		20	0.04071
		21	0.02489
		22	0.00658
		23	0.00151
		24	0.00009
27	VGL1165	13	0.00009
		14	0.00018
		15	0.00649
		16	0.04204
		17	0.00400
		18	0.01849
		19	0.00916
		20	0.00080
		21	0.07902
		22	0.00302
		23	0.00284
		24	0.01591
		25	0.11342
		25.3	0.00009
		26	0.47733
		27	0.10836
		28	0.11067
		29	0.00222
		30	0.00453
		31	0.00098
		32	0.00027
		34	0.00009
28	VGL1828	14	0.03724
		15	0.00053
		16	0.04684
		17	0.02293
		18	0.08738
		19	0.42551
		20	0.33902
		21	0.03342
		22	0.00702
		23	0.00009
29	VGL2009	9	0.45351
		10	0.00640
		11	0.03467
		12	0.04658
		13	0.24382
		14	0.18667
		15	0.02818
		16	0.00018
30	VGL2409	13	0.03930
		14	0.26347
		15	0.18522
		16	0.15410
		17	0.19918
		18	0.13454
		19	0.02374
		20	0.00044
31	VGL2918	7	0.00009
		12	0.00507
		13	0.11422
		14	0.20604
		15	0.15751
		16	0.04302
		16.3	0.00142
		17	0.00222
		17.3	0.03191
		18.3	0.02187
		19.3	0.11876
		20.3	0.11769
		21.3	0.14204
		22.3	0.03484
		23.3	0.00329
32	VGL3008	12	0.00009
		13	0.01164
		14	0.03378
		15	0.23484
		16	0.03813
		17	0.50098
		18	0.02542
		18.2	0.00018
		19	0.12862
		20	0.02391
		21	0.00231
		23	0.00009
33	VGL3235	12	0.15484
		13	0.04924
		14	0.15929
		15	0.04667
		16	0.29929
		17	0.22027
		18	0.06933
		19	0.00107

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Poodle

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	5627	10.121	3.735	0.680	0.700	0.030
	SE		0.641	0.230	0.017	0.017	0.003

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Poodle

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	5627	8.714	2.992	0.583	0.604	0.034
	SE		1.173	0.467	0.058	0.059	0.007

Standard genetic assessment for individual STR loci

Poodle

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	AHT121	5627	13	5.291	0.794	0.811	0.021
2	AHT137	5627	12	4.287	0.755	0.767	0.015
3	AHTH130	5627	11	4.239	0.736	0.764	0.036
4	AHTh171-A	5627	11	4.264	0.755	0.765	0.013
5	AHTh260	5627	10	2.667	0.606	0.625	0.030
6	AHTk211	5627	6	2.002	0.473	0.501	0.055
7	AHTk253	5627	7	3.909	0.737	0.744	0.009
8	C22.279	5627	8	3.295	0.704	0.697	-0.010
9	FH2001	5627	8	3.439	0.690	0.709	0.027
10	FH2054	5627	9	2.504	0.600	0.601	0.001
11	FH2848	5627	9	1.990	0.473	0.497	0.050
12	INRA21	5627	9	3.253	0.666	0.693	0.038
13	INU005	5627	9	2.147	0.511	0.534	0.043
14	INU030	5627	8	3.591	0.689	0.722	0.044
15	INU055	5627	8	3.614	0.711	0.723	0.017
16	LEI004	5627	6	2.077	0.514	0.519	0.008
17	REN105L03	5627	8	2.884	0.621	0.653	0.050
18	REN162C04	5627	8	2.905	0.621	0.656	0.053
19	REN169D01	5627	10	3.653	0.684	0.726	0.058
20	REN169O18	5627	8	2.368	0.553	0.578	0.042
21	REN247M23	5627	6	2.678	0.597	0.627	0.048
22	REN54P11	5627	9	3.919	0.700	0.745	0.060
23	REN64E19	5627	7	3.211	0.669	0.689	0.028
24	VGL0760	5627	16	6.198	0.828	0.839	0.013
25	VGL0910	5627	18	5.397	0.808	0.815	0.008
26	VGL1063	5627	17	6.313	0.820	0.842	0.026
27	VGL1165	5627	22	3.656	0.690	0.727	0.050
28	VGL1828	5627	10	3.237	0.669	0.691	0.032
29	VGL2009	5627	8	3.288	0.660	0.696	0.052
30	VGL2409	5627	8	5.338	0.805	0.813	0.010
31	VGL2918	5627	15	7.516	0.859	0.867	0.010
32	VGL3008	5627	12	3.062	0.662	0.673	0.017
33	VGL3235	5627	8	5.080	0.775	0.803	0.035

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Poodle

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	DLA I-3CCA	5627	15	3.452	0.687	0.710	0.033
2	DLA I-4ACA	5627	11	4.808	0.775	0.792	0.022
3	DLA I-4BCT	5627	6	2.566	0.588	0.610	0.036
4	DLA1131	5627	9	4.646	0.760	0.785	0.032
5	5ACA	5627	6	1.549	0.349	0.354	0.014
6	5ACT	5627	8	1.821	0.439	0.451	0.027
7	5BCA	5627	6	2.099	0.485	0.524	0.074

Veterinary Genetics Laboratory

Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Poodle

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA Class II Haplotype Frequencies

Allele Frequencies

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Standard genetic assessment for individual STR loci

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Contact the VGL

Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Poodle

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA Class II Haplotype Frequencies

Allele Frequencies

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Standard genetic assessment for individual STR loci

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Contact the VGL

Connect with us on social media