Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Poodle

Updated Nov 13, 2024

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA1 #	STR types	Poodle (n=5595)
1001	380 373 281 182	0.26595
1002	380 365 281 181	0.16095
1003	387 375 277 186	0.17417
1004	393 379 277 183	0.08391
1005	389 371 277 181	0.06944
1006	387 375 293 180	0.04924
1007	380 372 281 182	0.03351
1008	386 373 289 182	0.01242
1009	382 377 277 184	0.01501
1010	384 371 277 186	0.01135
1011	376 365 281 180	0.01921
1012	388 369 289 188	0.01466
1013	392 373 289 186	0.00849
1014	375 373 287 178	0.01090
1015	380 373 291 186	0.00125
1016	382 371 277 178	0.02082
1017	386 373 289 178	0.00241
1018	375 373 287 186	0.00974
1019	380 373 287 185	0.00295
1020	388 369 289 184	0.00286
1021	380 373 289 186	0.00170
1022	380 375 281 181	0.00009
1023	380 379 281 181	0.00009
1024	387 373 281 182	0.00009
1025	380 365 281 186	0.00018
1026	390 369 289 186	0.00331
1027	391 371 277 181	0.00045
1028	376 369 291 186	0.00107
1029	380 365 281 182	0.00161
1030	380 373 293 178	0.00214
1031	382 371 277 186	0.00125
1032	382 377 277 178	0.00009
1033	382 379 277 181	0.00340
1034	382 379 277 182	0.00054
1035	386 373 277 184	0.00009
1036	389 365 289 180	0.00161
1040	380 371 277 186	0.00054
1043	393 381 277 183	0.00143
1045	376 371 277 186	0.00063
1046	376 379 291 180	0.00036
1052	380 372 289 184	0.00036
1053	382 377 277 186	0.00018
1054	382 379 277 184	0.00018
1065	380 371 277 181	0.00018
1069	380 365 281 184	0.00009
1084	376 373 277 184	0.00027
1092	376 379 277 181	0.00018
1093	386 379 277 180	0.00045
1102	389 375 293 180	0.00009
1103	389 375 293 181	0.00018
1105	382 379 277 178	0.00375
1106	395 379 277 178	0.00009
1107	376 375 293 183	0.00018
1109	381 379 291 186	0.00152
1111	387 378 287 182	0.00009
1130	380 373 287 178	0.00009
1134	384 365 291 178	0.00018
1141	380 365 281 180	0.00018
1168	382 379 289 186	0.00018
1169	380 365 277 180	0.00098
1225	387 374 287 186	0.00009
1234	380 371 281 181	0.00018
1265	387 375 277 184	0.00009
1270	376 365 281 181	0.00009
1271	387 375 277 181	0.00018
1279	393 379 277 186	0.00009

DLA Class II Haplotype Frequencies

DLA2 #	STR types	Poodle (n=5595)
2001	343 324 284	0.60009
2002	343 327 280	0.08525
2003	343 324 282	0.10599
2004	351 327 268	0.03029
2005	339 322 280	0.01510
2006	339 325 280	0.03351
2007	351 327 280	0.01725
2008	339 327 276	0.01510
2009	351 324 280	0.00706
2010	345 329 280	0.01135
2011	345 322 284	0.01930
2012	345 322 280	0.00733
2013	345 327 284	0.01037
2014	339 322 284	0.01903
2015	339 327 280	0.00402
2016	339 323 284	0.00313
2017	343 322 280	0.00206
2019	345 324 284	0.00009
2020	349 324 284	0.00018
2021	339 324 268	0.00384
2022	339 327 282	0.00045
2023	341 323 282	0.00214
2024	343 323 280	0.00063
2025	351 321 280	0.00161
2026	351 324 284	0.00098
2028	345 327 288	0.00054
2032	339 323 280	0.00045
2035	341 323 280	0.00009
2037	341 327 280	0.00045
2039	345 327 276	0.00054
2040	345 327 280	0.00009
2048	339 331 282	0.00018
2050	341 327 284	0.00018
2053	343 324 280	0.00009
2064	351 327 284	0.00089
2066	339 324 280	0.00009
2101	341 324 280	0.00018
2115	343 327 284	0.00009

Allele Frequencies

#	Locus Name	Allele	Poodle (n=5598)
1	AHT121	92	0.01268
		94	0.02242
		96	0.01242
		98	0.31645
		100	0.08548
		102	0.00634
		104	0.19739
		106	0.08333
		108	0.17256
		110	0.06690
		112	0.02313
		114	0.00080
		116	0.00009
2	AHT137	131	0.23084
		133	0.01036
		135	0.00045
		137	0.17572
		139	0.00045
		141	0.36645
		143	0.01313
		145	0.04654
		147	0.05842
		149	0.00259
		151	0.09478
		153	0.00027
3	AHTH130	111	0.01692
		117	0.00235
		119	0.38020
		121	0.14160
		123	0.07799
		125	0.00118
		127	0.13310
		129	0.21697
		131	0.01511
		133	0.01249
		135	0.00208
4	AHTh171-A	217	0.00607
		219	0.37022
		221	0.23089
		223	0.00616
		225	0.14175
		227	0.00902
		229	0.04930
		231	0.02188
		233	0.00152
		235	0.14371
		237	0.01947
5	AHTh260	238	0.57407
		240	0.03118
		242	0.00027
		244	0.05843
		246	0.18710
		248	0.06433
		250	0.03395
		252	0.03654
		254	0.00617
		256	0.00795
6	AHTk211	87	0.18310
		89	0.03930
		91	0.67399
		93	0.00411
		95	0.09932
		97	0.00018
7	AHTk253	280	0.00893
		284	0.12826
		286	0.11370
		288	0.40479
		290	0.21392
		292	0.12969
		296	0.00071
8	C22.279	116	0.08003
		118	0.40095
		120	0.00473
		124	0.35602
		126	0.06815
		128	0.02170
		130	0.06833
		134	0.00009
9	FH2001	124	0.01992
		132	0.42763
		136	0.07076
		140	0.01823
		144	0.24062
		148	0.20926
		152	0.01242
		158	0.00116
10	FH2054	148	0.01063
		152	0.03136
		156	0.55163
		160	0.01760
		164	0.00348
		168	0.29614
		172	0.07736
		176	0.01081
		180	0.00098
11	FH2848	230	0.01528
		232	0.01555
		234	0.01260
		236	0.05325
		238	0.13733
		240	0.68862
		242	0.07684
		244	0.00018
		246	0.00036
12	INRA21	91	0.35423
		93	0.00009
		95	0.40398
		97	0.04770
		99	0.05538
		101	0.11424
		103	0.00750
		105	0.01393
		109	0.00295
13	INU005	110	0.01974
		120	0.00009
		122	0.00054
		124	0.51438
		126	0.44820
		128	0.00179
		130	0.01179
		132	0.00116
		138	0.00232
14	INU030	144	0.32315
		146	0.14952
		148	0.06502
		150	0.08700
		152	0.37415
		154	0.00080
		156	0.00027
		158	0.00009
15	INU055	208	0.00161
		210	0.21874
		212	0.05957
		214	0.29412
		216	0.36977
		218	0.03957
		220	0.01536
		222	0.00125
16	LEI004	85	0.65327
		95	0.10155
		97	0.00491
		105	0.00071
		107	0.20722
		109	0.03233
17	REN105L03	227	0.01027
		231	0.27908
		233	0.19725
		235	0.00741
		237	0.01492
		239	0.01179
		241	0.47901
		243	0.00027
18	REN162C04	200	0.02055
		202	0.17081
		204	0.06816
		206	0.54368
		208	0.08969
		210	0.06414
		212	0.04288
		214	0.00009
19	REN169D01	202	0.00985
		210	0.00125
		212	0.07071
		214	0.00090
		216	0.41103
		218	0.25698
		220	0.00197
		222	0.05057
		224	0.17481
		226	0.02193
20	REN169O18	156	0.00125
		160	0.03404
		162	0.56584
		164	0.31472
		166	0.01760
		168	0.02430
		170	0.03287
		172	0.00938
21	REN247M23	266	0.03395
		268	0.52787
		270	0.23280
		272	0.19823
		274	0.00250
		278	0.00465
22	REN54P11	222	0.00322
		226	0.26724
		228	0.16685
		230	0.00393
		232	0.33521
		234	0.20874
		236	0.00411
		238	0.00991
		242	0.00080
23	REN64E19	139	0.00241
		143	0.00509
		145	0.42721
		147	0.24616
		149	0.03537
		153	0.25741
		155	0.02635
24	VGL0760	12	0.29668
		13	0.00125
		14	0.01385
		15	0.00849
		18	0.00152
		19	0.08513
		19.2	0.14079
		20	0.03654
		20.2	0.16107
		21	0.00134
		21.2	0.05396
		22.2	0.01679
		23.2	0.10854
		24.2	0.05959
		25.2	0.01403
		26.2	0.00045
25	VGL0910	12	0.00045
		13	0.04877
		14	0.01715
		15	0.01894
		15.1	0.01581
		16	0.00027
		16.1	0.00482
		17.1	0.10745
		18.1	0.27215
		19	0.00009
		19.1	0.13005
		20.1	0.04198
		21.1	0.27608
		22	0.00732
		22.1	0.02313
		23	0.03055
		23.1	0.00375
		24	0.00125
26	VGL1063	8	0.02805
		9	0.00223
		10	0.00009
		11	0.00161
		12	0.03448
		13	0.16283
		14	0.13853
		15	0.08717
		16	0.09798
		17	0.03198
		18	0.04394
		19	0.29725
		20	0.04073
		21	0.02492
		22	0.00661
		23	0.00152
		24	0.00009
27	VGL1165	13	0.00009
		14	0.00018
		15	0.00652
		16	0.04189
		17	0.00402
		18	0.01858
		19	0.00911
		20	0.00080
		21	0.07905
		22	0.00304
		23	0.00286
		24	0.01590
		25	0.11388
		25.3	0.00009
		26	0.47731
		27	0.10825
		28	0.11066
		29	0.00223
		30	0.00420
		31	0.00098
		32	0.00027
		34	0.00009
28	VGL1828	14	0.03716
		15	0.00054
		16	0.04707
		17	0.02304
		18	0.08735
		19	0.42542
		20	0.33887
		21	0.03340
		22	0.00706
		23	0.00009
29	VGL2009	9	0.45320
		10	0.00616
		11	0.03474
		12	0.04671
		13	0.24366
		14	0.18703
		15	0.02831
		16	0.00018
30	VGL2409	13	0.03940
		14	0.26340
		15	0.18558
		16	0.15422
		17	0.19862
		18	0.13465
		19	0.02368
		20	0.00045
31	VGL2918	7	0.00009
		12	0.00509
		13	0.11442
		14	0.20516
		15	0.15765
		16	0.04323
		16.3	0.00143
		17	0.00223
		17.3	0.03198
		18.3	0.02179
		19.3	0.11852
		20.3	0.11808
		21.3	0.14219
		22.3	0.03492
		23.3	0.00322
32	VGL3008	12	0.00009
		13	0.01170
		14	0.03394
		15	0.23473
		16	0.03805
		17	0.50125
		18	0.02537
		18.2	0.00018
		19	0.12826
		20	0.02403
		21	0.00232
		23	0.00009
33	VGL3235	12	0.15514
		13	0.04930
		14	0.15827
		15	0.04662
		16	0.29948
		17	0.22053
		18	0.06958
		19	0.00107

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Poodle

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	5598	10.121	3.736	0.680	0.700	0.030
	SE		0.641	0.230	0.017	0.017	0.003

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Poodle

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	5598	8.714	2.991	0.583	0.604	0.034
	SE		1.173	0.467	0.058	0.059	0.007

Standard genetic assessment for individual STR loci

Poodle

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	AHT121	5598	13	5.291	0.794	0.811	0.020
2	AHT137	5598	12	4.286	0.756	0.767	0.014
3	AHTH130	5598	11	4.234	0.736	0.764	0.037
4	AHTh171-A	5598	11	4.263	0.755	0.765	0.013
5	AHTh260	5598	10	2.662	0.606	0.624	0.030
6	AHTk211	5598	6	2.003	0.473	0.501	0.055
7	AHTk253	5598	7	3.908	0.738	0.744	0.009
8	C22.279	5598	8	3.293	0.704	0.696	-0.011
9	FH2001	5598	8	3.443	0.690	0.710	0.028
10	FH2054	5598	9	2.503	0.600	0.600	0.001
11	FH2848	5598	9	1.990	0.473	0.498	0.050
12	INRA21	5598	9	3.254	0.667	0.693	0.038
13	INU005	5598	9	2.146	0.511	0.534	0.043
14	INU030	5598	8	3.590	0.690	0.721	0.043
15	INU055	5598	8	3.617	0.712	0.724	0.016
16	LEI004	5598	6	2.079	0.515	0.519	0.008
17	REN105L03	5598	8	2.884	0.620	0.653	0.050
18	REN162C04	5598	8	2.908	0.621	0.656	0.054
19	REN169D01	5598	10	3.654	0.685	0.726	0.057
20	REN169O18	5598	8	2.367	0.554	0.578	0.041
21	REN247M23	5598	6	2.679	0.597	0.627	0.048
22	REN54P11	5598	9	3.916	0.700	0.745	0.059
23	REN64E19	5598	7	3.212	0.669	0.689	0.028
24	VGL0760	5598	16	6.197	0.827	0.839	0.014
25	VGL0910	5598	18	5.395	0.808	0.815	0.008
26	VGL1063	5598	17	6.308	0.819	0.841	0.026
27	VGL1165	5598	22	3.656	0.690	0.726	0.050
28	VGL1828	5598	10	3.239	0.670	0.691	0.031
29	VGL2009	5598	8	3.290	0.660	0.696	0.052
30	VGL2409	5598	8	5.339	0.805	0.813	0.010
31	VGL2918	5598	15	7.526	0.859	0.867	0.010
32	VGL3008	5598	12	3.060	0.662	0.673	0.017
33	VGL3235	5598	8	5.079	0.775	0.803	0.035

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Poodle

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	DLA I-3CCA	5598	15	3.448	0.686	0.710	0.033
2	DLA I-4ACA	5598	11	4.811	0.775	0.792	0.022
3	DLA I-4BCT	5598	6	2.565	0.587	0.610	0.037
4	DLA1131	5598	9	4.642	0.760	0.785	0.032
5	5ACA	5598	6	1.549	0.349	0.354	0.015
6	5ACT	5598	8	1.821	0.439	0.451	0.027
7	5BCA	5598	6	2.100	0.485	0.524	0.074

Veterinary Genetics Laboratory

Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Poodle

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA Class II Haplotype Frequencies

Allele Frequencies

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Standard genetic assessment for individual STR loci

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Contact the VGL

Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Poodle

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA Class II Haplotype Frequencies

Allele Frequencies

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Standard genetic assessment for individual STR loci

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Contact the VGL

Connect with us on social media