Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Havanese

Updated Oct 28, 2026

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA1 #	STR types	Havanese (n=1184)
1003	387 375 277 186	0.0384
1006	387 375 293 180	0.0562
1009	382 377 277 184	0.0004
1011	376 365 281 180	0.0008
1012	388 369 289 188	0.0110
1014	375 373 287 178	0.0186
1016	382 371 277 178	0.1921
1017	386 373 289 178	0.0008
1018	375 373 287 186	0.0068
1019	380 373 287 185	0.0008
1029	380 365 281 182	0.0355
1030	380 373 293 178	0.0025
1033	382 379 277 181	0.0013
1035	386 373 277 184	0.0038
1040	380 371 277 186	0.0160
1052	380 372 289 184	0.0089
1054	382 379 277 184	0.1225
1062	382 371 277 183	0.0004
1068	380 373 287 181	0.0127
1071	380 373 277 178	0.0004
1084	376 373 277 184	0.0013
1087	380 371 277 178	0.0034
1092	376 379 277 181	0.0963
1093	386 379 277 180	0.0135
1105	382 379 277 178	0.0008
1111	387 378 287 182	0.0025
1114	380 373 287 183	0.0169
1115	386 371 277 182	0.0925
1116	380 365 289 186	0.1085
1117	376 373 277 180	0.0473
1118	376 377 277 180	0.0008
1120	376 386 289 176	0.0008
1121	380 371 277 183	0.0046
1123	386 379 277 184	0.0013
1124	388 373 289 178	0.0055
1125	393 383 277 185	0.0220
1128	384 376 287 182	0.0008
1129	382 371 277 181	0.0008
1132	376 379 277 184	0.0013
1133	378 365 287 172	0.0169
1134	384 365 291 178	0.0008
1136	382 371 277 182	0.0004
1140	376 379 301 180	0.0038
1142	376 379 277 180	0.0046
1147	391 375 293 180	0.0025
1148	376 375 277 180	0.0021
1154	376 365 281 183	0.0097
1155	388 369 287 184	0.0004
1173	392 371 277 186	0.0038
1180	386 371 277 181	0.0004
1260	387 379 277 184	0.0004
1262	382 377 289 180	0.0008
1266	378 365 287 181	0.0008
1290	380 369 277 181	0.0008
1300	388 369 260 184	0.0004

DLA Class II Haplotype Frequencies

DLA2 #	STR types	Havanese (n=1184)
2001	343 324 284	0.0427
2003	343 324 282	0.2141
2005	339 322 280	0.0025
2006	339 325 280	0.0013
2007	351 327 280	0.0587
2008	339 327 276	0.0004
2011	345 322 284	0.0004
2012	345 322 280	0.0025
2014	339 322 284	0.0034
2016	339 323 284	0.0266
2017	343 322 280	0.0097
2018	339 324 284	0.0249
2021	339 324 268	0.0046
2022	339 327 282	0.1153
2023	341 323 282	0.0025
2024	343 323 280	0.0034
2028	345 327 288	0.0008
2032	339 323 280	0.0182
2033	339 323 282	0.0013
2035	341 323 280	0.0021
2037	341 327 280	0.0186
2040	345 327 280	0.0038
2053	343 324 280	0.0287
2066	339 324 280	0.1639
2068	339 327 284	0.0004
2070	347 324 282	0.1081
2071	339 322 286	0.0046
2072	339 325 282	0.0169
2073	339 327 286	0.0084
2074	341 324 284	0.0473
2075	341 327 282	0.0363
2076	345 322 282	0.0055
2077	347 325 286	0.0169
2079	343 323 278	0.0008
2082	339 325 268	0.0038
2087	347 324 280	0.0004

Allele Frequencies

#	Locus Name	Allele	Havanese (n=1200)
1	AHT121	88	0.0004
		92	0.1067
		94	0.0775
		96	0.0021
		98	0.0096
		100	0.0471
		102	0.1058
		104	0.5296
		106	0.0350
		108	0.0821
		110	0.0013
		112	0.0029
2	AHT137	131	0.2342
		133	0.0621
		137	0.0817
		139	0.0400
		141	0.1783
		143	0.1121
		145	0.0079
		147	0.1988
		149	0.0650
		151	0.0192
		155	0.0008
3	AHTH130	117	0.0358
		119	0.2671
		121	0.0500
		123	0.0317
		125	0.3667
		127	0.1850
		129	0.0408
		131	0.0200
		133	0.0029
4	AHTh171-A	217	0.0017
		219	0.1617
		221	0.0013
		225	0.2550
		227	0.0304
		229	0.1863
		231	0.2771
		233	0.0204
		235	0.0383
		237	0.0279
5	AHTh260	238	0.1233
		242	0.0133
		244	0.2333
		246	0.2888
		248	0.2038
		250	0.1054
		252	0.0025
		254	0.0279
		258	0.0017
6	AHTk211	87	0.4746
		89	0.2258
		91	0.1454
		95	0.1429
		97	0.0113
7	AHTk253	284	0.0117
		286	0.0696
		288	0.6442
		290	0.0488
		292	0.2258
8	C22.279	116	0.1029
		118	0.2121
		120	0.0050
		122	0.0171
		124	0.2308
		126	0.1329
		128	0.0008
		130	0.2983
9	FH2001	124	0.0404
		128	0.0092
		132	0.4117
		136	0.0113
		140	0.0113
		144	0.4533
		148	0.0513
		152	0.0100
		158	0.0017
10	FH2054	148	0.0158
		152	0.0842
		156	0.2513
		160	0.1979
		164	0.0879
		168	0.1458
		172	0.1113
		176	0.1021
		180	0.0033
		184	0.0004
11	FH2848	230	0.0138
		232	0.3042
		234	0.0483
		236	0.0817
		238	0.0463
		240	0.2333
		242	0.2625
		244	0.0058
		246	0.0042
12	INRA21	91	0.1375
		95	0.0992
		97	0.3758
		99	0.0500
		101	0.1775
		103	0.1492
		105	0.0108
13	INU005	106	0.0008
		110	0.0308
		122	0.0133
		124	0.5871
		126	0.2175
		128	0.0088
		132	0.0275
		134	0.0046
		138	0.1096
14	INU030	144	0.6321
		146	0.0392
		148	0.0238
		150	0.1271
		152	0.1633
		154	0.0133
		156	0.0013
15	INU055	210	0.3742
		212	0.2058
		214	0.1004
		216	0.1300
		218	0.1842
		222	0.0054
16	LEI004	83	0.0004
		85	0.6408
		93	0.0004
		95	0.2258
		97	0.0146
		101	0.0017
		105	0.0004
		107	0.1088
		109	0.0071
17	REN105L03	227	0.0221
		229	0.0183
		231	0.2096
		233	0.0925
		235	0.0042
		237	0.1900
		239	0.0113
		241	0.4463
		245	0.0058
18	REN162C04	200	0.0346
		202	0.2196
		204	0.0492
		206	0.3971
		208	0.1288
		210	0.1708
19	REN169D01	202	0.0692
		204	0.0008
		210	0.1679
		212	0.0525
		214	0.0267
		216	0.4192
		218	0.0704
		220	0.1933
20	REN169O18	160	0.0708
		162	0.2042
		164	0.0438
		166	0.2317
		168	0.1850
		170	0.2342
		172	0.0304
21	REN247M23	266	0.0004
		268	0.4113
		270	0.1029
		272	0.1663
		274	0.0188
		276	0.2708
		278	0.0296
22	REN54P11	222	0.1688
		226	0.2663
		228	0.1117
		232	0.0900
		234	0.0596
		236	0.0413
		238	0.2625
23	REN64E19	139	0.1413
		143	0.0133
		145	0.0983
		147	0.3108
		149	0.0150
		151	0.0038
		153	0.3996
		155	0.0175
		157	0.0004
24	VGL0760	12	0.0317
		13	0.0608
		14	0.1029
		15	0.0096
		18.2	0.0971
		19.2	0.0025
		20.2	0.0171
		21.2	0.2333
		22.2	0.1704
		23.2	0.1608
		24.2	0.0500
		25.2	0.0300
		26.2	0.0333
		27.2	0.0004
25	VGL0910	13	0.0038
		14	0.0096
		16.1	0.0921
		17	0.0063
		17.1	0.1008
		18	0.0246
		18.1	0.0617
		19.1	0.1700
		20.1	0.0404
		20.3	0.0050
		21.1	0.3154
		22	0.0325
		22.1	0.1058
		23	0.0154
		23.1	0.0167
26	VGL1063	8	0.0233
		12	0.0842
		13	0.0396
		14	0.1983
		15	0.1029
		16	0.0071
		17	0.0875
		18	0.0688
		19	0.0438
		20	0.0863
		21	0.0892
		22	0.1567
		23	0.0125
27	VGL1165	14	0.0008
		15	0.0004
		16	0.0058
		17	0.0292
		18	0.1113
		19	0.0154
		20	0.0292
		21	0.1121
		22	0.0004
		23	0.0246
		25	0.0038
		26	0.3533
		27	0.0708
		28	0.1733
		29	0.0079
		30	0.0121
		31	0.0233
		32	0.0104
		33	0.0150
		34	0.0008
28	VGL1828	15	0.0146
		16	0.3088
		17	0.0050
		18	0.0213
		19	0.0325
		19.3	0.0029
		20	0.1088
		20.3	0.0004
		21	0.3600
		22	0.0633
		23	0.0817
		24	0.0008
29	VGL2009	9	0.0021
		10	0.0025
		11	0.1454
		12	0.0254
		13	0.2138
		14	0.2283
		15	0.2958
		16	0.0854
		17	0.0013
30	VGL2409	14	0.0117
		15	0.0700
		16	0.3267
		17	0.3254
		18	0.2125
		19	0.0029
		20	0.0417
		21	0.0092
31	VGL2918	12	0.0446
		13	0.2804
		14	0.1496
		15	0.0683
		16	0.0108
		16.3	0.0054
		17.3	0.0108
		18.3	0.0667
		19.3	0.0408
		20.3	0.0304
		21.3	0.0667
		22.3	0.2171
		23.3	0.0083
32	VGL3008	10	0.0004
		13	0.1283
		14	0.0083
		15	0.0704
		16	0.0263
		17	0.1104
		18	0.1542
		19	0.1771
		20	0.2033
		21	0.1038
		22	0.0104
		23	0.0071
33	VGL3235	11	0.0113
		12	0.0188
		13	0.1263
		14	0.2783
		15	0.3433
		16	0.0288
		17	0.0396
		18	0.0658
		19	0.0833
		20	0.0046

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Havanese

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	1200	9.515	4.477	0.731	0.748	0.023
	SE		0.535	0.268	0.016	0.016	0.004

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Havanese

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	1200	8.857	3.840	0.670	0.690	0.030
	SE		0.999	0.600	0.047	0.047	0.005

Standard genetic assessment for individual STR loci

Havanese

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	AHT121	1200	12	3.132	0.676	0.681	0.007
2	AHT137	1200	11	6.432	0.833	0.845	0.014
3	AHTH130	1200	9	4.051	0.716	0.753	0.050
4	AHTh171-A	1200	10	4.849	0.786	0.794	0.010
5	AHTh260	1200	9	4.840	0.770	0.793	0.029
6	AHTk211	1200	5	3.145	0.653	0.682	0.043
7	AHTk253	1200	5	2.113	0.485	0.527	0.079
8	C22.279	1200	8	4.633	0.758	0.784	0.034
9	FH2001	1200	9	2.634	0.626	0.620	-0.009
10	FH2054	1200	10	6.194	0.833	0.839	0.007
11	FH2848	1200	9	4.400	0.753	0.773	0.026
12	INRA21	1200	7	4.418	0.743	0.774	0.039
13	INU005	1200	9	2.463	0.595	0.594	-0.002
14	INU030	1200	7	2.249	0.545	0.555	0.019
15	INU055	1200	6	4.110	0.730	0.757	0.035
16	LEI004	1200	9	2.111	0.535	0.526	-0.017
17	REN105L03	1200	9	3.464	0.685	0.711	0.037
18	REN162C04	1200	6	3.917	0.731	0.745	0.019
19	REN169D01	1200	8	3.930	0.734	0.746	0.015
20	REN169O18	1200	7	5.201	0.793	0.808	0.018
21	REN247M23	1200	7	3.547	0.703	0.718	0.021
22	REN54P11	1200	7	5.152	0.773	0.806	0.041
23	REN64E19	1200	9	3.489	0.712	0.713	0.002
24	VGL0760	1200	14	7.196	0.852	0.861	0.011
25	VGL0910	1200	15	6.023	0.813	0.834	0.025
26	VGL1063	1200	13	8.806	0.877	0.886	0.011
27	VGL1165	1200	20	5.304	0.763	0.811	0.060
28	VGL1828	1200	12	4.013	0.763	0.751	-0.017
29	VGL2009	1200	9	4.663	0.758	0.786	0.036
30	VGL2409	1200	8	3.779	0.713	0.735	0.030
31	VGL2918	1200	13	6.002	0.826	0.833	0.009
32	VGL3008	1200	12	7.054	0.849	0.858	0.011
33	VGL3235	1200	10	4.435	0.733	0.775	0.053

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Havanese

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	DLA I-3CCA	1200	12	5.046	0.783	0.802	0.023
2	DLA I-4ACA	1200	12	4.703	0.761	0.787	0.034
3	DLA I-4BCT	1200	8	2.044	0.503	0.511	0.016
4	DLA1131	1200	11	6.660	0.833	0.850	0.019
5	5ACA	1200	6	3.590	0.701	0.721	0.029
6	5ACT	1200	5	2.130	0.501	0.530	0.056
7	5BCA	1200	8	2.708	0.608	0.631	0.036

Veterinary Genetics Laboratory

Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Havanese

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA Class II Haplotype Frequencies

Allele Frequencies

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Standard genetic assessment for individual STR loci

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Contact the VGL

Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Havanese

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA Class II Haplotype Frequencies

Allele Frequencies

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Standard genetic assessment for individual STR loci

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Contact the VGL

Connect with us on social media