Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Havanese

Updated Jun 11, 2026

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA1 #	STR types	Havanese (n=1182)
1003	387 375 277 186	0.0444
1006	387 375 293 180	0.0546
1009	382 377 277 184	0.0004
1011	376 365 281 180	0.0008
1012	388 369 289 188	0.0106
1014	375 373 287 178	0.0182
1016	382 371 277 178	0.1912
1017	386 373 289 178	0.0004
1018	375 373 287 186	0.0068
1019	380 373 287 185	0.0008
1029	380 365 281 182	0.0355
1030	380 373 293 178	0.0025
1033	382 379 277 181	0.0013
1035	386 373 277 184	0.0038
1040	380 371 277 186	0.0148
1052	380 372 289 184	0.0089
1054	382 379 277 184	0.1231
1062	382 371 277 183	0.0004
1068	380 373 287 181	0.0127
1071	380 373 277 178	0.0004
1084	376 373 277 184	0.0013
1087	380 371 277 178	0.0034
1092	376 379 277 181	0.0990
1093	386 379 277 180	0.0135
1105	382 379 277 178	0.0008
1111	387 378 287 182	0.0030
1114	380 373 287 183	0.0165
1115	386 371 277 182	0.0918
1116	380 365 289 186	0.1049
1117	376 373 277 180	0.0478
1118	376 377 277 180	0.0008
1120	376 386 289 176	0.0008
1121	380 371 277 183	0.0047
1123	386 379 277 184	0.0013
1124	388 373 289 178	0.0055
1125	393 383 277 185	0.0212
1128	384 376 287 182	0.0008
1129	382 371 277 181	0.0008
1132	376 379 277 184	0.0013
1133	378 365 287 172	0.0169
1134	384 365 291 178	0.0008
1136	382 371 277 182	0.0004
1140	376 379 301 180	0.0038
1142	376 379 277 180	0.0047
1147	391 375 293 180	0.0025
1148	376 375 277 180	0.0021
1154	376 365 281 183	0.0097
1155	388 369 287 184	0.0004
1173	392 371 277 186	0.0038
1180	386 371 277 181	0.0004
1260	387 379 277 184	0.0004
1262	382 377 289 180	0.0008
1266	378 365 287 181	0.0008
1290	380 369 277 181	0.0008
1300	388 369 260 184	0.0004

DLA Class II Haplotype Frequencies

DLA2 #	STR types	Havanese (n=1182)
2001	343 324 284	0.0491
2003	343 324 282	0.2153
2005	339 322 280	0.0021
2006	339 325 280	0.0013
2007	351 327 280	0.0571
2008	339 327 276	0.0004
2011	345 322 284	0.0004
2012	345 322 280	0.0025
2014	339 322 284	0.0034
2016	339 323 284	0.0258
2017	343 322 280	0.0097
2018	339 324 284	0.0250
2021	339 324 268	0.0047
2022	339 327 282	0.1159
2023	341 323 282	0.0025
2024	343 323 280	0.0038
2028	345 327 288	0.0008
2032	339 323 280	0.0182
2033	339 323 282	0.0013
2035	341 323 280	0.0021
2037	341 327 280	0.0182
2040	345 327 280	0.0038
2053	343 324 280	0.0275
2066	339 324 280	0.1629
2068	339 327 284	0.0004
2070	347 324 282	0.1045
2071	339 322 286	0.0047
2072	339 325 282	0.0165
2073	339 327 286	0.0085
2074	341 324 284	0.0478
2075	341 327 282	0.0364
2076	345 322 282	0.0055
2077	347 325 286	0.0169
2079	343 323 278	0.0008
2082	339 325 268	0.0038
2087	347 324 280	0.0004

Allele Frequencies

#	Locus Name	Allele	Havanese (n=1182)
1	AHT121	88	0.0004
		92	0.1053
		94	0.0766
		96	0.0021
		98	0.0097
		100	0.0465
		102	0.1062
		104	0.5317
		106	0.0351
		108	0.0821
		110	0.0013
		112	0.0030
2	AHT137	131	0.2331
		133	0.0618
		137	0.0825
		139	0.0393
		141	0.1785
		143	0.1125
		145	0.0080
		147	0.1997
		149	0.0643
		151	0.0195
		155	0.0008
3	AHTH130	117	0.0364
		119	0.2631
		121	0.0495
		123	0.0313
		125	0.3680
		127	0.1874
		129	0.0410
		131	0.0203
		133	0.0030
4	AHTh171-A	217	0.0017
		219	0.1603
		221	0.0013
		225	0.2563
		227	0.0288
		229	0.1874
		231	0.2771
		233	0.0203
		235	0.0389
		237	0.0279
5	AHTh260	238	0.1235
		242	0.0135
		244	0.2343
		246	0.2872
		248	0.2039
		250	0.1058
		252	0.0025
		254	0.0275
		258	0.0017
6	AHTk211	87	0.4746
		89	0.2263
		91	0.1468
		95	0.1413
		97	0.0110
7	AHTk253	284	0.0118
		286	0.0702
		288	0.6413
		290	0.0491
		292	0.2276
8	C22.279	116	0.1041
		118	0.2132
		120	0.0051
		122	0.0169
		124	0.2272
		126	0.1328
		128	0.0008
		130	0.2999
9	FH2001	124	0.0402
		128	0.0089
		132	0.4124
		136	0.0114
		140	0.0106
		144	0.4530
		148	0.0520
		152	0.0097
		158	0.0017
10	FH2054	148	0.0161
		152	0.0829
		156	0.2492
		160	0.2001
		164	0.0880
		168	0.1468
		172	0.1108
		176	0.1028
		180	0.0030
		184	0.0004
11	FH2848	230	0.0140
		232	0.3046
		234	0.0491
		236	0.0825
		238	0.0470
		240	0.2327
		242	0.2606
		244	0.0055
		246	0.0042
12	INRA21	91	0.1362
		95	0.0990
		97	0.3756
		99	0.0508
		101	0.1777
		103	0.1497
		105	0.0110
13	INU005	106	0.0008
		110	0.0305
		122	0.0135
		124	0.5880
		126	0.2174
		128	0.0089
		132	0.0266
		134	0.0038
		138	0.1104
14	INU030	144	0.6345
		146	0.0389
		148	0.0237
		150	0.1277
		152	0.1603
		154	0.0135
		156	0.0013
15	INU055	210	0.3739
		212	0.2064
		214	0.1007
		216	0.1286
		218	0.1849
		222	0.0055
16	LEI004	83	0.0004
		85	0.6409
		93	0.0004
		95	0.2255
		97	0.0135
		101	0.0017
		105	0.0004
		107	0.1100
		109	0.0072
17	REN105L03	227	0.0224
		229	0.0182
		231	0.2085
		233	0.0918
		235	0.0034
		237	0.1899
		239	0.0114
		241	0.4484
		245	0.0059
18	REN162C04	200	0.0351
		202	0.2195
		204	0.0486
		206	0.3972
		208	0.1282
		210	0.1713
19	REN169D01	202	0.0677
		204	0.0008
		210	0.1692
		212	0.0516
		214	0.0271
		216	0.4217
		218	0.0698
		220	0.1920
20	REN169O18	160	0.0698
		162	0.2039
		164	0.0423
		166	0.2335
		168	0.1849
		170	0.2348
		172	0.0309
21	REN247M23	266	0.0004
		268	0.4099
		270	0.1041
		272	0.1650
		274	0.0182
		276	0.2728
		278	0.0296
22	REN54P11	222	0.1684
		226	0.2669
		228	0.1104
		232	0.0905
		234	0.0605
		236	0.0398
		238	0.2635
23	REN64E19	139	0.1426
		143	0.0131
		145	0.0960
		147	0.3118
		149	0.0148
		151	0.0038
		153	0.3997
		155	0.0178
		157	0.0004
24	VGL0760	12	0.0321
		13	0.0609
		14	0.1036
		15	0.0097
		18.2	0.0986
		19.2	0.0025
		20.2	0.0169
		21.2	0.2327
		22.2	0.1705
		23.2	0.1612
		24.2	0.0499
		25.2	0.0283
		26.2	0.0326
		27.2	0.0004
25	VGL0910	13	0.0038
		14	0.0093
		16.1	0.0922
		17	0.0063
		17.1	0.1003
		18	0.0250
		18.1	0.0613
		19.1	0.1688
		20.1	0.0410
		20.3	0.0051
		21.1	0.3164
		22	0.0326
		22.1	0.1062
		23	0.0152
		23.1	0.0165
26	VGL1063	8	0.0237
		12	0.0838
		13	0.0402
		14	0.1980
		15	0.1036
		16	0.0072
		17	0.0867
		18	0.0694
		19	0.0440
		20	0.0859
		21	0.0888
		22	0.1561
		23	0.0127
27	VGL1165	14	0.0008
		15	0.0004
		16	0.0059
		17	0.0292
		18	0.1113
		19	0.0157
		20	0.0292
		21	0.1129
		22	0.0004
		23	0.0250
		25	0.0038
		26	0.3528
		27	0.0706
		28	0.1730
		29	0.0080
		30	0.0110
		31	0.0233
		32	0.0106
		33	0.0152
		34	0.0008
28	VGL1828	15	0.0144
		16	0.3050
		17	0.0051
		18	0.0216
		19	0.0317
		19.3	0.0030
		20	0.1100
		20.3	0.0004
		21	0.3617
		22	0.0643
		23	0.0821
		24	0.0008
29	VGL2009	9	0.0021
		10	0.0025
		11	0.1455
		12	0.0258
		13	0.2149
		14	0.2280
		15	0.2936
		16	0.0863
		17	0.0013
30	VGL2409	14	0.0118
		15	0.0698
		16	0.3287
		17	0.3232
		18	0.2124
		19	0.0030
		20	0.0423
		21	0.0089
31	VGL2918	12	0.0440
		13	0.2834
		14	0.1497
		15	0.0677
		16	0.0110
		16.3	0.0055
		17.3	0.0110
		18.3	0.0664
		19.3	0.0410
		20.3	0.0305
		21.3	0.0668
		22.3	0.2145
		23.3	0.0085
32	VGL3008	10	0.0004
		13	0.1273
		14	0.0085
		15	0.0711
		16	0.0266
		17	0.1100
		18	0.1536
		19	0.1772
		20	0.2039
		21	0.1036
		22	0.0106
		23	0.0072
33	VGL3235	11	0.0106
		12	0.0182
		13	0.1256
		14	0.2771
		15	0.3456
		16	0.0283
		17	0.0398
		18	0.0668
		19	0.0833
		20	0.0047

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Havanese

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	1182	9.515	4.475	0.730	0.747	0.023
	SE		0.535	0.268	0.016	0.016	0.004

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Havanese

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	1182	8.857	3.835	0.670	0.690	0.030
	SE		0.999	0.599	0.048	0.047	0.005

Standard genetic assessment for individual STR loci

Havanese

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	AHT121	1182	12	3.113	0.673	0.679	0.009
2	AHT137	1182	11	6.432	0.832	0.845	0.015
3	AHTH130	1182	9	4.054	0.717	0.753	0.048
4	AHTh171-A	1182	10	4.835	0.786	0.793	0.009
5	AHTh260	1182	9	4.845	0.769	0.794	0.031
6	AHTk211	1182	5	3.144	0.651	0.682	0.046
7	AHTk253	1182	5	2.125	0.487	0.529	0.080
8	C22.279	1182	8	4.634	0.756	0.784	0.036
9	FH2001	1182	9	2.631	0.623	0.620	-0.004
10	FH2054	1182	10	6.196	0.831	0.839	0.009
11	FH2848	1182	9	4.416	0.753	0.774	0.027
12	INRA21	1182	7	4.422	0.745	0.774	0.038
13	INU005	1182	9	2.456	0.595	0.593	-0.003
14	INU030	1182	7	2.238	0.544	0.553	0.016
15	INU055	1182	6	4.110	0.730	0.757	0.035
16	LEI004	1182	9	2.110	0.534	0.526	-0.015
17	REN105L03	1182	9	3.448	0.684	0.710	0.037
18	REN162C04	1182	6	3.916	0.730	0.745	0.020
19	REN169D01	1182	8	3.903	0.733	0.744	0.015
20	REN169O18	1182	7	5.181	0.794	0.807	0.017
21	REN247M23	1182	7	3.550	0.705	0.718	0.019
22	REN54P11	1182	7	5.137	0.772	0.805	0.042
23	REN64E19	1182	9	3.481	0.712	0.713	0.001
24	VGL0760	1182	14	7.189	0.852	0.861	0.010
25	VGL0910	1182	15	6.016	0.813	0.834	0.025
26	VGL1063	1182	13	8.831	0.876	0.887	0.013
27	VGL1165	1182	20	5.313	0.761	0.812	0.062
28	VGL1828	1182	12	4.024	0.766	0.751	-0.020
29	VGL2009	1182	9	4.681	0.759	0.786	0.035
30	VGL2409	1182	8	3.781	0.713	0.736	0.030
31	VGL2918	1182	13	5.985	0.826	0.833	0.009
32	VGL3008	1182	12	7.062	0.848	0.858	0.012
33	VGL3235	1182	10	4.420	0.732	0.774	0.054

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Havanese

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	DLA I-3CCA	1182	12	5.034	0.783	0.801	0.022
2	DLA I-4ACA	1182	12	4.692	0.761	0.787	0.033
3	DLA I-4BCT	1182	8	2.034	0.498	0.508	0.020
4	DLA1131	1182	11	6.654	0.835	0.850	0.017
5	5ACA	1182	6	3.581	0.701	0.721	0.028
6	5ACT	1182	5	2.130	0.500	0.531	0.058
7	5BCA	1182	8	2.719	0.611	0.632	0.034

Veterinary Genetics Laboratory

Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Havanese

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA Class II Haplotype Frequencies

Allele Frequencies

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Standard genetic assessment for individual STR loci

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Contact the VGL

Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Havanese

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA Class II Haplotype Frequencies

Allele Frequencies

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Standard genetic assessment for individual STR loci

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Contact the VGL

Connect with us on social media