Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Havanese

Updated Jul 15, 2026

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA1 #	STR types	Havanese (n=1186)
1003	387 375 277 186	0.0443
1006	387 375 293 180	0.0544
1009	382 377 277 184	0.0004
1011	376 365 281 180	0.0008
1012	388 369 289 188	0.0105
1014	375 373 287 178	0.0181
1016	382 371 277 178	0.1906
1017	386 373 289 178	0.0004
1018	375 373 287 186	0.0067
1019	380 373 287 185	0.0008
1029	380 365 281 182	0.0354
1030	380 373 293 178	0.0025
1033	382 379 277 181	0.0013
1035	386 373 277 184	0.0038
1040	380 371 277 186	0.0152
1052	380 372 289 184	0.0089
1054	382 379 277 184	0.1235
1062	382 371 277 183	0.0004
1068	380 373 287 181	0.0126
1071	380 373 277 178	0.0004
1084	376 373 277 184	0.0013
1087	380 371 277 178	0.0034
1092	376 379 277 181	0.0999
1093	386 379 277 180	0.0135
1105	382 379 277 178	0.0008
1111	387 378 287 182	0.0030
1114	380 373 287 183	0.0164
1115	386 371 277 182	0.0915
1116	380 365 289 186	0.1054
1117	376 373 277 180	0.0476
1118	376 377 277 180	0.0008
1120	376 386 289 176	0.0008
1121	380 371 277 183	0.0046
1123	386 379 277 184	0.0013
1124	388 373 289 178	0.0055
1125	393 383 277 185	0.0211
1128	384 376 287 182	0.0008
1129	382 371 277 181	0.0008
1132	376 379 277 184	0.0013
1133	378 365 287 172	0.0169
1134	384 365 291 178	0.0008
1136	382 371 277 182	0.0004
1140	376 379 301 180	0.0038
1142	376 379 277 180	0.0046
1147	391 375 293 180	0.0025
1148	376 375 277 180	0.0021
1154	376 365 281 183	0.0097
1155	388 369 287 184	0.0004
1173	392 371 277 186	0.0038
1180	386 371 277 181	0.0004
1260	387 379 277 184	0.0004
1262	382 377 289 180	0.0008
1266	378 365 287 181	0.0008
1290	380 369 277 181	0.0008
1300	388 369 260 184	0.0004

DLA Class II Haplotype Frequencies

DLA2 #	STR types	Havanese (n=1186)
2001	343 324 284	0.0489
2003	343 324 282	0.2159
2005	339 322 280	0.0021
2006	339 325 280	0.0013
2007	351 327 280	0.0569
2008	339 327 276	0.0004
2011	345 322 284	0.0004
2012	345 322 280	0.0025
2014	339 322 284	0.0034
2016	339 323 284	0.0257
2017	343 322 280	0.0097
2018	339 324 284	0.0249
2021	339 324 268	0.0046
2022	339 327 282	0.1164
2023	341 323 282	0.0025
2024	343 323 280	0.0038
2028	345 327 288	0.0008
2032	339 323 280	0.0181
2033	339 323 282	0.0013
2035	341 323 280	0.0021
2037	341 327 280	0.0181
2040	345 327 280	0.0038
2053	343 324 280	0.0278
2066	339 324 280	0.1623
2068	339 327 284	0.0004
2070	347 324 282	0.1050
2071	339 322 286	0.0046
2072	339 325 282	0.0164
2073	339 327 286	0.0084
2074	341 324 284	0.0476
2075	341 327 282	0.0363
2076	345 322 282	0.0055
2077	347 325 286	0.0169
2079	343 323 278	0.0008
2082	339 325 268	0.0038
2087	347 324 280	0.0004

Allele Frequencies

#	Locus Name	Allele	Havanese (n=1187)
1	AHT121	88	0.0004
		92	0.1066
		94	0.0767
		96	0.0021
		98	0.0097
		100	0.0463
		102	0.1057
		104	0.5312
		106	0.0350
		108	0.0821
		110	0.0013
		112	0.0029
2	AHT137	131	0.2334
		133	0.0619
		137	0.0821
		139	0.0400
		141	0.1786
		143	0.1120
		145	0.0080
		147	0.1992
		149	0.0644
		151	0.0194
		155	0.0008
3	AHTH130	117	0.0362
		119	0.2645
		121	0.0497
		123	0.0312
		125	0.3673
		127	0.1870
		129	0.0409
		131	0.0202
		133	0.0029
4	AHTh171-A	217	0.0017
		219	0.1609
		221	0.0013
		225	0.2553
		227	0.0291
		229	0.1870
		231	0.2776
		233	0.0206
		235	0.0388
		237	0.0278
5	AHTh260	238	0.1234
		242	0.0135
		244	0.2346
		246	0.2877
		248	0.2039
		250	0.1053
		252	0.0025
		254	0.0274
		258	0.0017
6	AHTk211	87	0.4747
		89	0.2262
		91	0.1466
		95	0.1415
		97	0.0110
7	AHTk253	284	0.0118
		286	0.0699
		288	0.6424
		290	0.0489
		292	0.2270
8	C22.279	116	0.1036
		118	0.2131
		120	0.0051
		122	0.0168
		124	0.2283
		126	0.1331
		128	0.0008
		130	0.2991
9	FH2001	124	0.0404
		128	0.0088
		132	0.4128
		136	0.0114
		140	0.0110
		144	0.4524
		148	0.0518
		152	0.0097
		158	0.0017
10	FH2054	148	0.0160
		152	0.0834
		156	0.2502
		160	0.1992
		164	0.0880
		168	0.1470
		172	0.1104
		176	0.1024
		180	0.0029
		184	0.0004
11	FH2848	230	0.0139
		232	0.3041
		234	0.0489
		236	0.0826
		238	0.0468
		240	0.2342
		242	0.2599
		244	0.0055
		246	0.0042
12	INRA21	91	0.1365
		95	0.0994
		97	0.3749
		99	0.0505
		101	0.1778
		103	0.1500
		105	0.0110
13	INU005	106	0.0008
		110	0.0307
		122	0.0135
		124	0.5885
		126	0.2174
		128	0.0088
		132	0.0265
		134	0.0038
		138	0.1099
14	INU030	144	0.6335
		146	0.0388
		148	0.0236
		150	0.1276
		152	0.1618
		154	0.0135
		156	0.0013
15	INU055	210	0.3745
		212	0.2060
		214	0.1003
		216	0.1289
		218	0.1849
		222	0.0055
16	LEI004	83	0.0004
		85	0.6411
		93	0.0004
		95	0.2258
		97	0.0135
		101	0.0017
		105	0.0004
		107	0.1095
		109	0.0072
17	REN105L03	227	0.0223
		229	0.0181
		231	0.2089
		233	0.0927
		235	0.0034
		237	0.1904
		239	0.0114
		241	0.4469
		245	0.0059
18	REN162C04	200	0.0350
		202	0.2195
		204	0.0489
		206	0.3968
		208	0.1289
		210	0.1710
19	REN169D01	202	0.0682
		204	0.0008
		210	0.1689
		212	0.0518
		214	0.0270
		216	0.4208
		218	0.0699
		220	0.1925
20	REN169O18	160	0.0699
		162	0.2043
		164	0.0425
		166	0.2325
		168	0.1853
		170	0.2346
		172	0.0307
21	REN247M23	266	0.0004
		268	0.4111
		270	0.1036
		272	0.1647
		274	0.0185
		276	0.2717
		278	0.0299
22	REN54P11	222	0.1685
		226	0.2671
		228	0.1099
		232	0.0906
		234	0.0602
		236	0.0409
		238	0.2628
23	REN64E19	139	0.1424
		143	0.0131
		145	0.0969
		147	0.3113
		149	0.0152
		151	0.0038
		153	0.3993
		155	0.0177
		157	0.0004
24	VGL0760	12	0.0320
		13	0.0611
		14	0.1032
		15	0.0097
		18.2	0.0981
		19.2	0.0025
		20.2	0.0168
		21.2	0.2325
		22.2	0.1710
		23.2	0.1609
		24.2	0.0501
		25.2	0.0291
		26.2	0.0324
		27.2	0.0004
25	VGL0910	13	0.0038
		14	0.0097
		16.1	0.0922
		17	0.0063
		17.1	0.1011
		18	0.0249
		18.1	0.0611
		19.1	0.1693
		20.1	0.0409
		20.3	0.0051
		21.1	0.3151
		22	0.0324
		22.1	0.1066
		23	0.0152
		23.1	0.0164
26	VGL1063	8	0.0236
		12	0.0842
		13	0.0400
		14	0.1980
		15	0.1032
		16	0.0072
		17	0.0872
		18	0.0691
		19	0.0438
		20	0.0859
		21	0.0893
		22	0.1559
		23	0.0126
27	VGL1165	14	0.0008
		15	0.0004
		16	0.0059
		17	0.0291
		18	0.1112
		19	0.0156
		20	0.0291
		21	0.1129
		22	0.0004
		23	0.0249
		25	0.0038
		26	0.3530
		27	0.0708
		28	0.1731
		29	0.0080
		30	0.0114
		31	0.0232
		32	0.0105
		33	0.0152
		34	0.0008
28	VGL1828	15	0.0143
		16	0.3058
		17	0.0051
		18	0.0215
		19	0.0320
		19.3	0.0029
		20	0.1099
		20.3	0.0004
		21	0.3610
		22	0.0640
		23	0.0821
		24	0.0008
29	VGL2009	9	0.0021
		10	0.0025
		11	0.1457
		12	0.0257
		13	0.2144
		14	0.2283
		15	0.2936
		16	0.0864
		17	0.0013
30	VGL2409	14	0.0118
		15	0.0695
		16	0.3277
		17	0.3239
		18	0.2127
		19	0.0029
		20	0.0421
		21	0.0093
31	VGL2918	12	0.0438
		13	0.2826
		14	0.1491
		15	0.0682
		16	0.0110
		16.3	0.0055
		17.3	0.0110
		18.3	0.0670
		19.3	0.0413
		20.3	0.0307
		21.3	0.0666
		22.3	0.2148
		23.3	0.0084
32	VGL3008	10	0.0004
		13	0.1276
		14	0.0084
		15	0.0708
		16	0.0265
		17	0.1099
		18	0.1537
		19	0.1773
		20	0.2035
		21	0.1040
		22	0.0105
		23	0.0072
33	VGL3235	11	0.0110
		12	0.0181
		13	0.1259
		14	0.2772
		15	0.3446
		16	0.0286
		17	0.0396
		18	0.0666
		19	0.0838
		20	0.0046

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Havanese

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	1187	9.515	4.477	0.730	0.748	0.023
	SE		0.535	0.268	0.016	0.016	0.004

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Havanese

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	1187	8.857	3.834	0.669	0.690	0.032
	SE		0.999	0.600	0.048	0.047	0.005

Standard genetic assessment for individual STR loci

Havanese

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	AHT121	1187	12	3.117	0.673	0.679	0.009
2	AHT137	1187	11	6.436	0.832	0.845	0.016
3	AHTH130	1187	9	4.053	0.718	0.753	0.047
4	AHTh171-A	1187	10	4.839	0.786	0.793	0.009
5	AHTh260	1187	9	4.839	0.769	0.793	0.030
6	AHTk211	1187	5	3.143	0.652	0.682	0.044
7	AHTk253	1187	5	2.120	0.486	0.528	0.080
8	C22.279	1187	8	4.635	0.757	0.784	0.035
9	FH2001	1187	9	2.633	0.624	0.620	-0.007
10	FH2054	1187	10	6.190	0.832	0.838	0.008
11	FH2848	1187	9	4.415	0.752	0.773	0.027
12	INRA21	1187	7	4.428	0.744	0.774	0.039
13	INU005	1187	9	2.454	0.595	0.592	-0.004
14	INU030	1187	7	2.242	0.545	0.554	0.016
15	INU055	1187	6	4.106	0.730	0.756	0.036
16	LEI004	1187	9	2.109	0.534	0.526	-0.016
17	REN105L03	1187	9	3.457	0.683	0.711	0.039
18	REN162C04	1187	6	3.920	0.730	0.745	0.021
19	REN169D01	1187	8	3.912	0.734	0.744	0.014
20	REN169O18	1187	7	5.185	0.794	0.807	0.017
21	REN247M23	1187	7	3.547	0.703	0.718	0.020
22	REN54P11	1187	7	5.144	0.772	0.806	0.042
23	REN64E19	1187	9	3.487	0.712	0.713	0.002
24	VGL0760	1187	14	7.192	0.851	0.861	0.012
25	VGL0910	1187	15	6.032	0.813	0.834	0.025
26	VGL1063	1187	13	8.830	0.876	0.887	0.012
27	VGL1165	1187	20	5.309	0.762	0.812	0.062
28	VGL1828	1187	12	4.024	0.767	0.752	-0.020
29	VGL2009	1187	9	4.680	0.758	0.786	0.036
30	VGL2409	1187	8	3.782	0.713	0.736	0.031
31	VGL2918	1187	13	5.997	0.826	0.833	0.008
32	VGL3008	1187	12	7.061	0.848	0.858	0.012
33	VGL3235	1187	10	4.430	0.733	0.774	0.053

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Havanese

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	DLA I-3CCA	1187	12	5.034	0.782	0.801	0.024
2	DLA I-4ACA	1187	12	4.689	0.760	0.787	0.034
3	DLA I-4BCT	1187	8	2.033	0.499	0.508	0.018
4	DLA1131	1187	11	6.660	0.833	0.850	0.020
5	5ACA	1187	6	3.580	0.699	0.721	0.030
6	5ACT	1187	5	2.127	0.498	0.530	0.060
7	5BCA	1187	8	2.713	0.610	0.631	0.034

Veterinary Genetics Laboratory

Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Havanese

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA Class II Haplotype Frequencies

Allele Frequencies

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Standard genetic assessment for individual STR loci

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Contact the VGL

Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Havanese

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA Class II Haplotype Frequencies

Allele Frequencies

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Standard genetic assessment for individual STR loci

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Contact the VGL

Connect with us on social media